应用物理系成立于2009年，其前身是始建于2004年的应用物理教研室，2009年随着学校学科和院系结构调整成立应用物理系，现有“应用物理学”本科专业和“物理学（理学）”一级硕士学位授权点，有一个校级研究机构—量子信息技术研究所。      

应用物理系教师近年来先后承担省级教改项目2项，学校教改和课程建设项目多项，出版教材3部，获全国多媒体课件大赛二等奖1项。先后承担国家自然科学基金项目8项，省部级项目14项，厅局级项目20余项；获省部级科研奖励4项，厅局级奖励7项。近五年共在Physical Review A、Scientific Reports、New Journal of Physics和等国际权威期刊发表SCI检索论文200余篇，其中二区及以上期刊论文30余篇。（2019年10月9日更新）